考虑到后世的物种入侵，他又让司农寺和海关成立一个机构，专门负责物种出入境管理。
只有确定对农业生产有益的，才能被引进来。
大明的物种外出，同样需要检验。
茶种、蚕种这类大明的优势产业种子，都在禁止出境之列。
朱由检可不希望它们被洋人盗走，给大明的相关产业带来竞争者。
为此，他要求司农寺和保密司合作，对需要严格保密的物种加强保密。
并且对洋人出入大明内地，做出更多限制。除了设有外贸园的城市外，其他地方不欢迎没有大明国籍的洋人。
这是为了保密做出的规定，却又一次波及到景教会。
徐光启在朝会结束后，向汤若望等景教会高层道：
“有了这个限制，以后传教就更难了。”
“没有大明国籍的传教士，只能在外贸园传教。”
这对景教会来说，又是重重一击。
此前因为原罪论和纳妾等争论，有许多中国信徒退教。
孙元化出使归来带来坏消息、并且带头退教后，景教会的中国教士和信徒就更少了。
这个曾经接近万人的宗教，到现在信徒和教士加起来，已经不足三千人。
等到皇帝的限制落实下去，无法去各地自由传教的景教，信徒数量还会下跌。
汤若望忧心忡忡道：
“不能再这样下去了！”
“必须拿出办法来。”
龙华民无奈地道：
“能有什么办法？”
“教廷不会允许景教独立。”
“大明的天子也不会允许景教被教廷控制。”
“咱们夹在中间能怎么办？”
艾儒略站起来道：
“不能再犹豫下去了！”
“咱们景教古已有之，本就是独立宗教。”
“和天主教、东正教的关系，只是信奉同一个神灵而已。”
“东方世界的基督徒，都应该属于景教会。”
强烈要求景教会从教廷独立，成为东正教那样的教派。
他相信在大明的支持下，东方世界的基督徒，都会属于景教会。
作为“西来孔子”，景教会三巨头之一，艾儒略在教廷影响非凡。
尤其是现在残存的信徒，有三分之一都是他发展而来。
在他出声之后，很快就有传教士附和。中国出身的教士和
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