为逃命路费，之后与拉德尔等人一起藏在山中的滑雪小屋里，等待战争的结束。
1945年5月8日德国正式宣布投降。
此时斯科尔兹内仍在山间小屋里平安地过日子，直到有一天山谷间的农民来报告说美军正在全力搜捕他，斯科尔兹内才下决心向美军投降。
他给附近的美军指挥官写了一封信，让这位农民带去，然而这信却如泥牛入海，几天后他又写了一封信，结果仍是毫无动静，讽刺的是此时美军仍在通过电台和报纸在全欧洲通缉他。最后斯科尔兹内决定带着拉德尔和另外两名手下下山投降。
然而即使向美军投降也不是一帆风顺的。他们到了萨尔茨堡的美军司令部，向一名上士说出了自己的身份，这位上士却说不曾听到过有关斯科尔兹内来投降时如何处置的指示，于是又派人驱车带他们前往师部。路上开车的美军士兵得知他的大名后竟然说：“如果你真的是斯科尔兹内的话，就痛快的喝一顿吧！因为今晚你可能就上绞架了！”
在第42师的司令部，没人对斯科尔兹内一行表示出有兴趣的样子，还让他们靠边站。然而在他们的身份被核实后情况就不同了，斯科尔兹内回忆道：“一下子从房间的四个房门里出来四个士兵，都把手里的冲锋枪对准了我。”
在美军司令部里，斯科尔兹内先被搜身检查毒药，然后反绑着双手牵到了记者招待会上。他的投降成了当天最轰动的新闻。
1947年8月18日，已在战俘营中度过了2年时光的斯科尔兹内与其他10名党卫军战犯一起被带到达豪接受审判。美军军事法庭对斯科尔兹内的指控主要有两点：1、指使第150装甲旅的士兵伪装成美军，使用美军的旗帜、徽章和制服，混入盟军队伍中制造混乱，这违反了国际法中关于“在实际交战中，交战双方必须明确身份”的原则；2、企图谋杀艾森豪威尔。
斯科尔兹内的辩护律师罗伯特·达斯多则强调，第150旅的士兵们只是在夜幕中前往目标的过程中身穿美军制服，而一旦被发现，他们立即脱掉美国军服，恢复德军装扮。而关于在实际战斗中使用敌方制服方面，当时的相关法律中的
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