位于曲阜城东南的尼山之上。
这里是孔子诞生地，书院依山而建，环境清幽。
尼山书院的学风重礼，讲究仪式规范。山长姓孔，是衍圣公府的旁支，讲授《周礼》《仪礼》时，往往亲自示范礼仪动作。
秦浩然在尼山书院，不仅学了礼制知识，更亲身参与了书院的日常礼仪，晨昏定省，朔望祭祀，处处按古礼而行。
第三站是春秋书院，位于曲阜城内。此书院以研究《春秋》经传著称，学风严谨，注重考据。
山长姓左，是研究《左传》的大家，授课时旁征博引，字字有据。
秦浩然在这里接触到了更深入的经学考据方法，学会了如何辨析历代注疏的真伪异同。
最后一站是石门书院，在曲阜城西的石门山下。
这里的学风最重实学，不仅讲经义，还讲水利、农桑、算术等实用之学。
山长姓曾，曾游历各地，见多识广。秦浩然在石门书院，将自己沿途考察水利、漕运的见闻与师长同窗交流，得到了不少启发。
在四大书院游学期间，秦浩然结交了不少同窗。有出身圣贤世家的，如颜学子、曾学子；有寒门苦读的，如来自山东其他府县的士子，也有像他一样游学至此的外地举人。
大家切磋学问，辩论经义，偶尔也结伴游览曲阜名胜，除了孔庙孔林，还有颜庙、周公庙、少昊陵等。
通过这些交往，秦浩然对曲阜乃至山东的社会状况有了更深的了解。
最让他触目惊心的，是土地兼并问题。正因为土地兼并导致这里的学子，更加渴望功名。
一次与几位同窗在茶馆闲谈，说到今年收成，一位来自兖州农村的寒门学子叹道：“如今乡下，十户里有七八户是佃农。好一点的地，都被城里的大户、书院里的教授、还有衍圣公府的管事们占去了。普通百姓，只能租地种，交了租子，剩下的勉强糊口。”
秦浩然心中一动，故意问道：“衍圣公府也占地？”
那位学子苦笑：“秦兄是外地人，不知内情。衍圣公府是圣人之后，朝廷优免赋税，赐予祭田。但历年代代下来，祭田越圈越多，周边的民田也渐渐被吞并。如今曲阜周边，最好的田地，十之三四都在孔府名下。”
另一位本地学子低声道：“何止田地。
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